عنوان انگلیسی: High-Throughput Simultaneous Analysis of RNA, Protein, and Lipid Biomarkers in Heterogeneous Tissue Samples
سال نشر: ۲۰۱۱
نویسنده: Vladimír Reiser,Ryan C Smith,Jiyan Xue,Marc M Kurtz,Rong Liu,Cheryl LeGrand,Xuanmin He,Xiang Yu,Peggy Wong,John S Hinchcliffe,Michael R Tanen,Gloria Lazar,Renata Zieba,Marina Ichetovkin,Zhu Chen,Edward A O’Neill,Wesley K Tanaka,Matthew J Marton,Jason Liao,Mark Morris,Eric Hailman,George Y Tokiwa,Andrew S Plump
تعداد صفحه فارسی: ۲۱ – تعداد صفحه انگلیسی: ۱۱
دانشگاه: Merck Sharp & Dohme Corporation, Whitehouse Station, NJ,Merck Sharp & Dohme Corporation, Whitehouse Station, NJ,Merck Sharp & Dohme Corporation, Whitehouse Station, NJ,Merck Sharp & Dohme Corporation, Whitehouse Station, NJ,Merck Sharp & Dohme Corporation, Whitehouse Station, NJ,Merck Sharp & Dohme Corporation, Whitehouse Station, NJ,ev3, Inc. Plymouth, MN,Merck Sharp & Dohme Corporation, Whitehouse Station, NJ,Merck Sharp & Dohme Corporation, Whitehouse Station, NJ,Merck Sharp & Dohme Corporati
نشریه: Process Safety and Environmental Protection
کیفیت ترجمه: ترجمه پلاس
چکیده
پیش¬زمینه: با تلاش¬هایی در جهت گسترش بیومارکرها و افزایش هزینه¬ی تهیه¬ی دارو بیشینه سازی مقدار نمونه¬های بالینی با وزن محدود، ضروری است. محدودیت اصلی روش¬های دردسترس ناتوانی در زمینه¬ی تحلیل و جداسازی از یک نمونه است که مولکول¬ها به روش¬های استخراج ناسازگاز نیاز دارند. بنابراین روش نیمه¬خودکار جدیدی برای فراوری بافت و تقطیع بافتی و تقسیم (TMAD) را گسترش دادیم.
روش¬ها: ما از یک ابزار SilverHawk برای جمع¬آوری پلاک¬های آترواسکلروزی از بیماران نیازمند به آتروکتومی پیرامونی استفاده کردیم. حفاظت بافتی با استفاده از فریز کردن فلش با ایمرسیون در RNAlater و خرد کردن بافتی با استفاده از هاون با TMAD مورد مقایسه قرار گرفت. موارد مقایسه بازده پروتئین¬ها، RNA، لیپید و کیفیت آن¬ها بودند. تکرارپذیری محصول آنالیت از بخش¬هایی از نمونه¬ی بافتی مشابه که بوسیله¬ی TMAD فراوری شده بود نیز مورد سنجش قرار گرفت.
نتایج: کمیت و کیفیت بیومارکرهای مستخرج از بافت که با TMAD آماده شد حداقل به اندازه¬ی آنجه از بافت ذخیره شده و آماده شده با روش¬های قدیمی تهیه می¬شد، نبود. TMAD تحلیل موازی بیان ژن (PCR کمی معکوس، می
روش¬ها: ما از یک ابزار SilverHawk برای جمع¬آوری پلاک¬های آترواسکلروزی از بیماران نیازمند به آتروکتومی پیرامونی استفاده کردیم. حفاظت بافتی با استفاده از فریز کردن فلش با ایمرسیون در RNAlater و خرد کردن بافتی با استفاده از هاون با TMAD مورد مقایسه قرار گرفت. موارد مقایسه بازده پروتئین¬ها، RNA، لیپید و کیفیت آن¬ها بودند. تکرارپذیری محصول آنالیت از بخش¬هایی از نمونه¬ی بافتی مشابه که بوسیله¬ی TMAD فراوری شده بود نیز مورد سنجش قرار گرفت.
نتایج: کمیت و کیفیت بیومارکرهای مستخرج از بافت که با TMAD آماده شد حداقل به اندازه¬ی آنجه از بافت ذخیره شده و آماده شده با روش¬های قدیمی تهیه می¬شد، نبود. TMAD تحلیل موازی بیان ژن (PCR کمی معکوس، می
Abstract
BACKGROUND: With expanding biomarker discovery efforts and increasing costs of drug development, it is critical to maximize the value of mass-limited clinical samples. The main limitation of available methods is the
inability to isolate and analyze,from a single sample, molecules requiring incompatible extraction methods. Thus,
we developed a novel semiautomated method for tissue
processing and tissue milling and division (TMAD).
METHODS: We used a SilverHawk atherectomy catheter to
collect atherosclerotic plaquesfrom patients requiring peripheral atherectomy. Tissue preservation by flash freezing was compared with immersion in RNAlater, and
tissue grinding by traditional mortar and pestle was compared with TMAD. Comparators were protein, RNA, and
lipid yield and quality. Reproducibility of analyte yield
from aliquots of the same tissue sample processed by
TMAD was also measured.
RESULTS: The quantity and quality of biomarkers extracted from tissue prepared by TMAD was at lea
inability to isolate and analyze,from a single sample, molecules requiring incompatible extraction methods. Thus,
we developed a novel semiautomated method for tissue
processing and tissue milling and division (TMAD).
METHODS: We used a SilverHawk atherectomy catheter to
collect atherosclerotic plaquesfrom patients requiring peripheral atherectomy. Tissue preservation by flash freezing was compared with immersion in RNAlater, and
tissue grinding by traditional mortar and pestle was compared with TMAD. Comparators were protein, RNA, and
lipid yield and quality. Reproducibility of analyte yield
from aliquots of the same tissue sample processed by
TMAD was also measured.
RESULTS: The quantity and quality of biomarkers extracted from tissue prepared by TMAD was at lea
محصولات مشابه
امتیاز شما:
(No Ratings Yet)
(No Ratings Yet)