پردازش پرس و جو خصوصی و کارآمد بر روی پایگاه داده های ژنومی فعالیت های خارجی

برنامه‌های کاربردی مطالعات ژنومی به سرعت در بسیاری از حوزه‌های علم و فن‌آوری از جمله بهداشت، تحقیقات پزشکی، خدمات مصرف‌کننده مستقیم، و قانونی و قانونی در حال گسترش است. با این حال، تعدادی موانع وجود دارند که دسترسی و پردازش یک پایگاه‌داده ژنومی بزرگ برای این کاربردها را مشکل می‌سازند. اول، توالی ژنومی توالی یک فرآیند زمان‌بر و هزینه‌بر است. دوم، نیاز به محاسبات گسترده و سیستم‌های ذخیره‌سازی برای پردازش توالی‌های ژنومی دارد. سوم، پایگاه‌های اطلاعاتی ژنومی اغلب متعلق به سازمان‌های مختلف هستند و در نتیجه برای استفاده عمومی در دسترس نیستند. پارادایم محاسبات ابری را می توان برای تسهیل ایجاد و به اشتراک گذاری پایگاه‌های اطلاعاتی ژنومی بزرگ برای این کاربردها استفاده کرد. صاحبان داده‌های ژنومی می‌توانند پایگاه‌داده خود را در یک سرور ابری متمرکز برون سپاری کنند تا دسترسی پایگاه‌های اطلاعاتی آن‌ها تسهیل شود. با این حال، صاحبان داده‌ها تمایلی به اتخاذ این مدل ندارند، چرا که نیاز به برون سپاری داده‌ها به یک ارائه کننده خدمات ابری غیرواقعی دارد که ممکن است موجب نقض داده‌ها شود. در این مقاله، ما یک

Applications of genomic studies are spreading rapidly in many domains of science and technology such as healthcare, biomedical research, direct-to-consumer services, and legal and forensic. However, there are a number of obstacles that make it hard to access and process a big genomic database for these applications. First, sequencing genomic sequence is a time consuming and expensive process. Second, it requires large-scale computation and storage systems to process genomic sequences. Third, genomic databases are often owned by different organizations, and thus, not available for public usage. Cloud computing paradigm can be leveraged to facilitate the creation and sharing of big genomic databases for these applications. Genomic data owners can outsource their databases in a centralized cloud server to ease the access of their databases. However, data owners are reluctant to adopt this model, as it requires outsourcing the data to an untrusted cloud service provider that may cause data